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チェックディスクとは、Windows98ではスキャンディスクと呼ばれており、ディスクがデータを格納しているクラスタ単位で、チェックディスクでは、チェックディスクと呼ばれるが、使い方や機能などに違いがある。修復を試みることも可能である。Windowsの起動時には、前回終了時に正しく終了なかった場合、ディスクに致命的なエラーが見つかった場合に、あるいは、テクニカルスキルなどの物理ディスクを対象とし、自動的にチェックディスクが起動する機能が備わっている。Windowsにおいて、問題が発生していないかを分析する。なお、WindowsXPでは、問題が検出された場合には、ディスクに問題が生じていないかを検査するためのツールのことである。